番禺校区是学校的主校区，占地面积较大，拥有现代化的教学楼、实验室、图书馆和体育设施等，是学校教学和科研的重要基地。越秀校区则是学校早期的校区，也有一些教学设施和实验室，但相比番禺校区来说，设施较为陈旧。两个校区的临床医学专业设置有所不同，番禺校区临床医学专业更加注重实践和创新能力的培养，为学生提供了更多的实践机会和科研项目，而越秀校区的临床医学专业则更加注重基础理论和医学知识的学习。