如果下游被认定为虚开，上游也应该积极配合相关调查和询问，提供相关的业务资料和财务资料，并如实反映情况，回答调查询问。同时，上游也应该积极采取措施，包括与下游协商解决，以解决虚开的问题，并避免类似问题再次发生。