不一样。西南大学柑桔研究所是的研究机构，其毕业证和西南大学本部的毕业证不同。尽管两者都是由西南大学颁发，但毕业证上的具体内容和格式会有所不同，因为毕业证是根据所在学院和专业的要求而制定的。