1、成分不同。多美素主要成分为多西环素，是一种四环素类抗生素；多柔比星主要成分为环丙沙星，是一种氟喹诺酮类抗生素。2、作用机理不同。多美素通过抑制细菌的蛋白质合成来发挥抗菌作用；多柔比星则是通过抑制细菌DNA合成来发挥抗菌作用。3、适应症不同。多美素主要用于治疗革兰阳性和阴性菌引起的感染，如呼吸道感染、泌尿道感染、皮肤软组织感染等；多柔比星主要用于治疗呼吸道感染、泌尿道感染、肠道感染、性传播疾病等。