1、计算方式不同：396利是指企业实际支付的融资利率，计算公式为实际融资成本=利息支出除以实际融资额；而369利是指企业在不同融资方式下的融资成本加权平均值，计算公式为加权平均融资成本的等于（短期借款利率乘以短期借款占比加长期借款利率乘长期借款占比加股票发行成本乘股票占比）除以（短期借款占比加长期借款占比加股票占比）。2、涵义不同：396利是指企业实际支付的融资成本，反映了企业融资的实际情况；而369利是指企业在不同融资方式下的融资成本加权平均值，反映了企业融资的整体情况，包括了不同融资方式的影响。