不经过。从文山市到普者黑高铁站没有直达大巴，需要中转。目前可以先从文山市坐大巴到砚山市，再从砚山市乘坐前往普者黑高铁站的大巴。砚山市到普者黑高铁站有多趟班车，大约需要1-1.5小时左右。