ERIC-PCR与RAPD-PCR区别是,更稳定,重复性更好,具备RAPD-PCR要求模板序列已知而直接进行扩增的优点,又由于其引物序列较长(一对22个碱基的引物),PCR反应退火温度较高(RAPD-PCR一般为40左右,而ERIC-PCR为52左右),所以能得到图谱稳定、重复性高,并能产生多种独特的扩增产物(50~3000bp),可根据扩增产物的电泳条带来区分细菌的株(型)。