1、非转基因大豆和转基因大豆产量不同。为什么现在转基因的大豆与大豆有那么多？其实就是因为转基因的大豆产量是非转基因的数倍。正因如此，转基因大豆才收到很多种植机构或者种植户的青睐。但是在另一方面，转基因的大豆的营养并没有非转基因的大豆要高，但这也是非常可惜的一点。2、发芽的能力不同。我们只要用水浸泡大豆三天，就能够从发芽程度上进行判断。转基因大豆是不会发芽的，只会变得个体膨胀；而非转基因大豆就能很清晰的看到芽苗生长出来。3、大豆虫蛀程度不同。由于转基因大豆转入了抗虫、抗药的基因，所以转基因的大豆通常形态整洁，几乎看不到任何虫蛀痕迹。而非转基因若是保存不当便容易生虫。4、颜色不一样。