1、种类不同。2、外形不同。3、颜色不同。4、采摘周期不同。5、口感不同。可可豆是可可树的果实，属于梧桐科可可属。咖啡豆是咖啡果的果核，属于茜草科咖啡属。可可豆比咖啡豆更大，表面也比咖啡豆更粗糙。生有可可豆的可可果大而饱满，长有咖啡豆的咖啡果外形更小，长得更密集。未经过发酵加工的可可豆外面有一层白色的果肉，咖啡豆未经加工之前的颜色有点像栗子肉，二者都是烘烤后变为深褐色的。