蜥蜴大部分的种类为肉食性，以昆虫、蚯蚓、蜗牛甚至老鼠等为食，但也有以仙人掌或海藻为主食或是杂食性的，壁虎类夜晚活动，以鳞翅目等昆虫为食物，体型较大的蜥蜴也可以吃小鸟及其他蜥蜴，巨蜥则可吃鱼、蛙甚至捕食小型哺乳动物。