缴费标准不同、报销比例不同、参保范围不同、参保年限不同。缴费标准：在缴费金额上，社保远高于新型农村合作医疗制度。新型农村合作医疗制度的年缴费金额仅为200元左右，而社会保障制度的最低缴费金额为每年1千元以上，而且工资越高，缴纳金额越高。