柯基犬存在以下几个缺点：
1.服从性差：柯基的脾气倔强，想要勉强它做事是比较难的，因此服从性比较差，需要从小进行调教;
2.腰椎易受伤：柯基腿短身长的特点，导致它的腰椎非常不好，承受着巨大的压力，特别是上下楼梯时最容易损伤;
3.喜欢拆家：柯基虽然体型小，但它有着非常充沛的精力，因此在无聊时经常会啃咬家具，尤其喜欢咬人的脚后跟。
另外，还有部分柯基犬的肠胃也比较脆弱，当主人进行投喂时，需要注意尽量以为主，避免大量喂食肉食，并且可在柯基消化不良时，喂食一些益生菌，促进它的肠胃蠕动。同时柯基也是出了名的爱掉毛，一整年都不消停，尤其是掉毛期的时候，情况更加严重，因此主人最好在平时给它多梳理毛发，多吃一些过咸过油的食物。