狗狗人工授精痛苦是比较小的，但如果手法不到位，重复插入输精管授精，母犬就会感觉比较疼痛。狗狗的人工授精技术目前已经比较成熟，因此对狗狗危害并不大，而且受精成功的概率还会大大提高。此外狗狗进行人工授精时，还能通过挑选公犬的优质精液来增加幼崽的存活率，并且克服母犬和公犬因体型差异过大而造成的交配障碍，效率也更快。
因此当狗狗出现交配难、不孕不育等情况时，人工授精是一个比较好的选择，但需要注意的是，一定要寻找一个熟练的医生进行操作，这样能够减少狗狗的痛苦，成功率也会更高。狗狗进行人工授精还能在一定程度上防止疾病的感染，因为这种方式能够避免公犬和母犬的生殖器直接接触，如果是自然配种则可能会导致寄生虫或生殖器疾病交叉感染。