1、概念不同
银行承兑汇票是商业汇票的一种。指由在承兑银行开立存款账户的存款人签发，向开户银行申请并经银行审查同意承兑的，保证在指定日期无条件支付确定的金额给收款人或持票人的票据。
商业承兑汇票是商业汇票的一种。是指收款人开出经付款人承兑，或由付款人开出并承兑的汇票。使用汇票的单位必须是在人民银行开立账户的法人，要以合法的商品交易为基础，而且汇票经承兑后，承兑人(即付款人)便负有到期无条件支付票款的责任，同时汇票可以向银行贴现，也可以流通转让。
2、信用等级不同
商业承兑汇票和银行承兑汇票的承兑人不同，决定了商业承兑汇票是商业信用，银行承兑汇票是银行信用。现实交易中，接收票据的一方更偏向选择银行承兑汇票。
3、处理方式不同
银行承兑汇票到期时，如果购货企业不能足额支付票款，承兑银行按承兑协议，按逾期借款处理，并计收罚息。银行会付款给持票人，可以按期收回货款。商业承兑汇票到期时，账户没有足够的钱。银行不负责付款，由购销双方自行处理。
4、适用对象不同
商业承兑汇票适用持未到期商业承兑汇票需现款支付的经工商行政管理部门（或主管机关）核准登记的信誉度较高，现金流较为充足，还款能力较强的企（事）业法人、其他经济组或个体工商户。