切开后菠萝蜜的保存：可以用保鲜膜将菠萝蜜果肉包裹后，放置通风环境较好的位置保存；也可以用保鲜膜或玻璃罐将其包裹后，放在冰箱冷藏保存，因为低温环境可以延长其新鲜度，但不宜长时间存放；还可以将其加工成菠萝蜜干保存，即用微波炉或烤箱用小火慢烤，逐步将水分烘干即可。
完整菠萝蜜的保存：放在阴凉通风处即可。其保存时长需要根据成熟度决定，如果其外皮为青绿色，那么可以放一个月左右;如果表皮带有黑褐色，那么放3至7天左右就要切开吃掉，否则会逐渐腐烂变质。