机箱底部风扇和显卡不冲突，机箱风扇是可以改善机箱内整体温度的，加快机箱内空气流动速度的。 机箱内温度降下去了，显卡、CPU等等配件的温度都会有所好转。
一般机箱风扇是装在机箱前部的，将冷空气从前部吸入吹向主板上空，最后由电源风扇排出，形成对流。最好考虑空气流动方向问题 ，最佳方案是前后各装一个风扇，成对角方向分布，然后整个机箱散热效果就很好。机箱前部风扇对里面吹，后部风扇对外面吹。
形成对流CPU、显卡、硬盘、光驱、北桥、南桥及板卡上的其他芯片时刻在加热机箱内的空气，如果不将这些热气排出箱外，将严重影响各部件散热，影响电脑的使用寿命。实测表明，装了机箱风扇的机箱比没装的机箱，箱内温度要低5～10℃，可明显改善箱内配件及电器元件的工作环境。
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