生物医学工程类专业与生物技术、生物工程、生物科学等“天坑”专业还是很不一样的，该专业对口就业并不算差，而且名校毕业的话，就业还是很好的。该专业虽不像计算机软件等热门专业一样就业岗位非常多，但也远比生物工程、生物技术、生物科学等专业好找工作。
生物医学工程专业可在生物医学工程领域，从事生物医学工程基础理论的科学研究，医疗仪器设备的设计、开发与维护，医学信息系统的软、硬件的研发，以及电子信息领域的科研及技术管理工作。例如：医疗器械研发、调试维修、医药代表、影像设备的操纵、设备维护、设备管理等等。
生物医学工程专业毕业就业方向1：各级医院的医学工程处、设备处、信息中心以及医学影像科也是毕业生非常愿意去的地方。这些地方工作稳定大多属于事业单位，竞争压力也是比较大的。
生物医学工程专业毕业就业方向2：进入国家医疗器械司及各级医疗器械检测所。
生物医学工程专业毕业就业方向3：去各大以及国内医疗器械企业，另外，就是各类医疗器械代理公司。
由于生物医学工程学科是应用最先进的理工科的理论与方法来研究人的生命现象与规律，因此其研究领域极其广泛，其研究方向也非常多。在每一个方向上又有着非常宽广的内容。
生物医学工程专业毕业生可在管理机构和国家机关，医学机构(临床研究、高度专业化的医学护理，管理) , 在医疗器械的使用、销售和服务上，研究所，大学(基础研究，教学)，国际制药、保健品企业(管理、研究和开发)，私人机构等方向工作。
毕业生也可直接参加高度专业化的医学护理和解决临床基础研究的问题，由他们研制的器械和系统对于疾病的观察、诊断、治疗、缓解起着很重要的作用。 随着科学技术的发展，各类大型医疗设备在医院中的应用越来越广泛，大型医疗设备的操作、维修及管理人员是各大医院及公司急需的人才。由此可见生物医学工程专业有广阔的就业前景。
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