对于土地征收纠纷应主要从以下几方面进行审查：
1、土地征收的工作程序是否合法。根据《国土资源部关于完善征地补偿安置制度的指导意见》之规定，土地征收的工作程序为：
（1）告知征地情况。在征地依法报批前，当地国土资源管理部门应将拟征地的用途、位置、补偿标准、安置途径等，以书面形式告知被征地农村集体组织和农户。在告知后，凡被征地农村集体经济组织和农户在拟征地土地上抢栽、抢种、抢建的地上附着物和青苗，征地时一律不予补偿。
（2）确认征地调查结果。当地国地资源管理部门应对拟征土地的权属、地类、面积以及地上附着物权属、种类、数量等现状进行调查，调查结果应与被征地农村集体经济组织、农户和地上附着物产权人共同确认。
（3）组织征地听证。在征地依法报批前，当地国土资源管理部门应告知被征地农村集体经济组织和农户，其对拟征地地的补偿标准、安置途径有申请听证的权利。当事人申请听证的，应按《国土资源听证规定》规定的程序和有关要求组织听证。据此，如果市、县国土资源行政主管部门在征地过程中没有按照上述程序来做，将导致错误的征地审批。
2、土地征收的批准机关是否有批准权。根据《土地管理法》第45条第1款、第2款的规定，土地征收由和省级批准。据此，土地征收除和省级有批准权外，其他各级机关均无权批准。
3、征收农用地是否办理农用地转用审批手续。《土地管理法》第45条第3款规定：征收农用地的，应当依照本法第44条的规定先行办理征地审批手续，不再另行办理征地审批；经省、自治区、直辖市在征地批准权限内批准农用地转用的，同时办理征地审批手续，不再另行办理征地审批，超过征地批准权限的，应当依照本条第1款的规定另行办理征地审批。据此，在征收农用地时，如果没有经有权机关批准农用地转用而直接办理征地审批的，是违法的征地审批。也就是说，农用地转用是土地征收的前置程序。
4、土地征收是否按照土地利用总体规划确定的用途批准。
5、征收决定是否发生效力。
6、土地征收方案批准文件是否在规定的时间、地点内予以公告。
7、土地征收公告的内容是否合法。
8、土地征收的批准文件是否有效。根据《关于完善农用地转用和土地征收审查报批工作的意见》的规定，土地征收批准文件的有效期为2年。土地征收经依法批准后，市、县2年内未用地或者未实施征地补偿安置方案的，有关批准文件自动失效。
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