立案调查是纪委常用说法，指国家工作人员（党员）涉嫌违纪问题，由纪委予以立案，通常下一步措施是两规，查实后进行党纪政纪处分，如涉嫌犯罪则移送司法机关。
立案侦查是或检察机关常用说法，指嫌疑人涉嫌违法犯罪问题，由司法机关予以立案，通常下一步是采取拘留逮捕监视居住等法律措施，查实后移送。
以上调查和侦查分别对应的是两个不同的职能部门，纪委有调查权，、检察的侦查机关有侦查权。
一、机关侦查程序是怎样的？
1、侦查行为
在我国，侦查行为既包括侦查人员依法进行的专门调查活动，又包括为防止现行犯、犯罪嫌疑人继续犯罪、逃跑、毁灭证据或自杀等而采取的强制措施。根据刑事诉讼法的规定，我国侦查行为的体系，应当包含以下内容：询问犯罪嫌疑人，询问证人、被害人，勘验、检查、搜查，扣押物证、书证、鉴定、通缉、拘传、取保候审、监视居住、拘留、逮捕等。
2、侦查终结
侦查终结是指侦查机关通过侦查，认为案件事实已经查清，证据确实充分，足以认定犯罪嫌疑人是否犯罪和应否对其追究刑事责任而决定结束侦查，依法对案件做出处理或提出处理意见的一项诉讼活动。
3、补充侦查
补充侦查是指机关或人民依照法定程序，在原有侦查工作的基础上，就案件中部分事实、情况重新进行侦查活动。补充侦查在程序上有以下三种：
（1）审查批捕阶段的补充侦查；
（2）审查起诉阶段的补充侦查；
（3）法庭审理阶段的补充侦查。
如果是由机关侦查终结，人民审查之后，需要补充侦查时，既可以决定将案件退回机关补充侦查，也可以决定自行侦查，必要时可以要求机关协助。但是，如果是人民自行侦查终结的案件需要补充侦查的，则不能退由机关补充侦查。
二、立案侦查期限是多久
立案后抓捕犯罪嫌疑人的期限没有规定。逮捕嫌疑人之后的侦查期限，一般是2个月，特殊情况下经依法批准可以延长1到5个月。
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