1.组织他人偷越国(边)境，运送他人偷越国(边)境，对被组织人、被运送人有杀害、伤害、强奸、拐卖等犯罪行为，或者对检查人员有杀害、伤害等犯罪行为的，依照数罪并罚的规定处罚。
2.犯组织、领导、参加恐怖活动组织罪，并实施杀人、爆炸、绑架等犯罪的，依照数罪并罚的规定处罚。
3.组织、领导、参加性质的组织又有其他犯罪行为的，依照数罪并罚的规定处罚;对于性质组织的组织者、领导者，应当按照其所组织、领导的性质组织所犯的全部罪行处罚;对于性质组织的参加者，应当按照其所参与的犯罪处罚。
4.收买被拐卖的妇女、儿童，又强奸被收买的妇女的，数罪并罚;收买被拐卖的妇女、儿童，又有非法拘禁、伤害、侮辱等犯罪行为的，数罪并罚。
5.行为人出售、运输假币构成犯罪，同时有使用假币行为的，依照《刑法》第171条出售、运输假币罪、第172条使用假币罪的规定，实行数罪并罚。
6.以暴力、威胁方法抗拒缉私的，以走私罪和妨害公务罪，依照数罪并罚的规定处罚。
7.实施《刑法》第140条至第14规定的犯罪，又以暴力、威胁方法抗拒查处，构成其他犯罪的，依照数罪并罚的规定处罚。
8.犯保险诈骗罪，投保人、被保险人故意造成财产损失的保险事故，或者投保人、受益人故意造成被保险人死亡、伤残或者疾病，同时构成其他犯罪的，依照数罪并罚的规定处罚。
9.因挪用索取构成犯罪的，依照数罪并罚的规定处罚。挪用进行非法活动构成其他犯罪的，依照数罪并罚的规定处罚。
10.纳税人缴纳税款后，采取假报出口或者其他欺骗手段，骗取国家出口退税款的，以偷税罪定罪处罚;骗取税款超过所缴纳的税款部分的，以骗取出口退税罪定罪处罚。并以偷税罪和骗取出口退税罪数罪并罚。
按照数罪并罚来判处的情形有很多，主要就是上文提到的几种情形。同时在进行数罪并罚的时候，需要按照数罪并罚的三种原则来进行判决，非死刑还有无期徒刑的，最长的判决期限为25年。
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