计划养殖者需持设施农用地建设方案及用地协议向所在地乡镇提出用地申请。乡镇依据设施农用地管理的有关规定对经营者提交的资料进行审查，符合要求的，由乡镇牵头，会同区国土、农业、畜牧、环保等部门及计划养殖者对项目用地进行现场踏勘。畜牧部门具体审核畜禽养殖场规模布局及畜禽种类是否符合畜牧规划要求。符合规定要求的，由乡镇报区审批。经区批准后，计划养殖者方可建设生产设施用地，而后经国土部门会同相关部门初验符合设计要求的，国土部门向经营者颁发设施农用地备案通知书，计划养殖者方准建设附属设施用地。
兴办规模化畜禽养殖的个人提出项目建设书面申请，经镇同意后，由畜牧主管部门办理项目备案手续，经审核同意的予以项目备案;兴办规模化畜禽养殖的个人持畜牧主管部门出具的项目备案表，到国土资源部门提出用地申请，具体落实项目用地选址、合理确定用地位置、范围、面积等;畜禽养殖个人与被用地的农村集体经济组织或土地承包经营权人签订农村土地出租、转包合同，占用耕地的，还应写出复耕保证书;畜禽养殖个人持项目备案表、土地出租或转包合同、标有尺寸的平面布置图、位置图(涉及占用耕地的还应出具复耕保证书)等文件资料，到国土资源部门办理用地备案手续，经审核同意的予以用地备案。
农村办理养殖场的申请流程
1、需要办理养殖项目个人申请，先经村镇同意后，到畜牧部门办理养殖备案手续。
2、携带个人养殖申请、村镇证明、养殖备案手续到当地国土所申请办理养殖用地备案手续。
3、国土所进行现场测量，出具地类、规划等证明，签订土地复耕协议，报国土局审查备案。
4、如果养殖用地建设了永久性建筑，则还需要办理农业用地转建设用地的审批手续，然后还要缴纳一定的使用费和造地费。
法律依据:
《中华人民共和国土地管理法》
第二十五条：经批准的土地利用总体规划的修改，须经原批准机关批准；未经批准，不得改变土地利用总体规划确定的土地用途。经批准的大型能源、交通、水利等基础设施建设用地，需要改变土地利用总体规划的，根据的批准文件修改土地利用总体规划。经省、自治区、直辖市批准的能源、交通、水利等基础设施建设用地，需要改变土地利用总体规划的，属于省级土地利用总体规划批准权限内的，根据省级的批准文件修改土地利用总体规划。
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