《劳动争议调解仲裁法》第27条规定：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。同理，用人单位处理违纪职工的时效也可以确定为1年，处理时效从用人单位证实或者应当证实职工犯错误之日起算。
劳动者发生违纪，一般都会侵犯用人单位的合法权益，比如劳动者旷工侵犯了用人单位的劳动义务获取权；劳动者失职侵犯了用人单位的管理权；劳动者兼职且拒不改正则侵犯了用人单位对劳动者完整工作精力的获得权；哪怕是劳动者被追究刑事责任，也将影响到用人单位的社会形象。因此，用人单位对违纪职工实施处理，其目的就是维护自身的合法权利。
一、公司员工违规违纪处理的流程是怎么样的
首先，应注意核实是否有员工违纪的相关证据，如否，需先进行相关证据的搜集，并且及时将证据保留存档，为将来产生损害赔偿或解除劳动合同关系等提供证据支持；
其次，查看相关规章制度或管理规定，以确定是否具备可对该员工该等行为进行处罚的相关依据（前提是该等规章制度必须依法履行了民主程序并向劳动者进行了告知）；
如没有相关规章制度依据，需进一步核实是否具备相关法律法规依据。
综上，当员工出现违纪行为时，企业首先要做的，应该是确定是否有法可依，即是否具备对该违纪员工进行处罚的相关法律依据或规章制度依据，这是前提。
《工资支付暂行规定》第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％．若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
二、员工严重违纪的情形有哪些
员工严重违纪的行为如下：
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，规定劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
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