建设工程纠纷的解决方式包括自行协商和达成和解、调解、仲裁以及诉讼。建设工程合同备案需要网上申报并办理备案手续。建设工程施工合同纠纷的诉讼时效为三年，可中断并重新计算。
法律分析
一、建设工程纠纷约定仲裁是否有效
建设工程纠纷约定仲裁是有效的，具体处理如下：
1.当事人自行协商解决合同纠纷，当事人在自愿互谅的基础上达成和解协议；
2.调解，双方当事人自愿在第三者的主持下进行调解；
3.仲裁，由第三者依据双方当事人在合同中订立的仲裁条款或自愿达成的仲裁协议；
4.诉讼，是解决合同纠纷的最终形式。
二、如何进行建设工程合同备案
法律对于建设工程合同的备案有具体的规定，备案的流程包括以下几项：
1.网上申报。上首先承包人登陆门户网站，然后在建设工程合同备案管理信息系统进行合同备案网上申报，根据合同的具体性质、内容在对应的合同备案表中填写相关信息，打印出带条型码的合同备案表。
2.办理备案手续。合同当事人携带相关资料到合同备案管理机构办理合同备案手续。
3.正式签发合同备案表。备案机构审核合同当事人提供的合同备案资料，符合要求的，加盖合同备案专用章。
三、建设工程施工合同纠纷的诉讼时效是多久
建设工程施工合同纠纷的诉讼时效是三年，从知道或者应当知道权利被侵害时起计算。如果有以下情形之一的，则诉讼时效中断，诉讼时效期间从中断、有关程序终结时起重新计算：
1.权利人向义务人提出履行请求;
2.义务人同意履行义务;
3.权利人提起诉讼或者申请仲裁;
4.与提起诉讼或者申请仲裁具有同等效力的其他情形。
结语
建设工程纠纷的解决方式多样，其中约定仲裁是一种有效的方式。当事人可以通过协商、调解、仲裁或诉讼来解决纠纷。同时，建设工程合同备案是一个必要的流程，需要在门户网站进行网上申报，并办理备案手续，最终获得合同备案表。对于建设工程施工合同纠纷的诉讼时效，一般为三年，但在特定情况下会中断并重新计算。建设工程纠纷的解决和合同备案都需要遵守相关法律规定，以确保合法权益的保护。
法律依据
中华人民共和国仲裁法（2017修正）：第三章 仲裁协议 第十九条 仲裁协议存在，合同的变更、解除、终止或者无效，不影响仲裁协议的效力。
仲裁庭有权确认合同的效力。
中华人民共和国仲裁法（2017修正）：第八章 附 则 第七十五条 中国仲裁协会制定仲裁规则前，仲裁委员会依照本法和民事诉讼法的有关规定可以制定仲裁暂行规则。
中华人民共和国仲裁法（2017修正）：第三章 仲裁协议 第十七条 有下列情形之一的，仲裁协议无效：
（一）约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围的；
（二）无民事行为能力人或者民事行为能力人订立的仲裁协议；
（三）一方采取胁迫手段，迫使对方订立仲裁协议的。
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