自产农产品销售开票方式如下：
1、若农产品为自产，销售时可免征；需收购企业出具证明收购到出卖人的证明和农产品的自产证明等资料，到国税局开具免税；
2、若农产品非自产，销售时应开具专用，税率为11%；
3、农副产品开具时，应按号码顺序填写，确保填写项目齐全、内容真实、字迹清楚，所有联次内容一致，并加盖专用章；
4、专用开具时，应在开票系统中填写购货方信息、选择货物名称及规格型号，输入数量和含税单价，系统自动转换为不含税价，核对价税合计后打印。
自产农产品销售的开票方式：
1. 使用农产品销售统一：这是专门为农产品销售设计的类型，适用于农民或农业生产者销售自产的农产品；
2. 开具普通：如果农民或农业生产者注册成为小规模纳税人，可以选择开具普通；
3. 开具专用：对于注册成为一般纳税人的农民或农业生产者，可以开具专用，允许买方抵扣进项税；
4. 使用收购或销售：在某些地区，农民销售自产农产品给收购企业时，可以使用收购或销售；
5. 通过电子系统开票：符合条件的农民或农业生产者可以通过国家电子系统开具电子，便于管理和存档。
综上所述，自产农产品销售时可免征，需提供相应证明材料并开具免税；非自产农产品销售时应开具专用，税率为11%；农副产品应按规定填写并加盖专用章；专用开具时需填写购货方信息并核对价税合计后打印。
【法律依据】：
《中华人民共和国暂行条例》
第二条
税率：
（一）纳税人销售货物、劳务、有形动产租赁服务或者进口货物，除本条第二项、第四项、第五项另有规定外，税率为17%。
（二）纳税人销售交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权，销售或者进口下列货物，税率为11%：
1.粮食等农产品、食用植物油、食用盐；
2.自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、二甲醚、沼气、居民用煤炭制品；
3.图书、报纸、杂志、音像制品、电子出版物；
4.饲料、化肥、农药、农机、农膜；
5.规定的其他货物。
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