事业单位年服务期内员工辞职,会有违约金。依据我国劳动合同的规定，如果用人单位为劳动者提供专项培训费用，并且签订服务期协议的，劳动者提前离职的，要承担违约的责任。用人单位与劳动者约定服务期的，不影响按照正常的工资调整机制提高劳动者在服务期期间的劳动报酬。
劳动者违反规定或劳动合同的约定解除劳动合同，对用人单位造成损失的，劳动者应赔偿用人单位下列损失：
1、 用人单位招收录用其所支付的费用;
2、 用人单位为其支付的培训费用，双方另有约定的按约定办理;
3 、对生产、经营和工作造成的直接经济损失;
4 、劳动合同约定的其他赔偿费用。
【本文所涉及的法律依据】：：
《中华人民共和国民法典》
第五百零二条
依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
依照法律、行规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。
依照法律、行规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。
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