农民的土地使用权会受到保护。农民集体所有的土地依法属于村农民集体所有，由村集体经济组织或者村民委员会经营、管理。农民所有的土地由县级登记造册，核发证书确认所有权，受法律保护。
一、农村房子土地使用证怎么办？
农村房屋土地使用证办理流程如下：
1、到所在地村委会以书面形式提出申请；
2、提交相关材料交由乡镇审核；
3、进行实地测量；
4、上报至县审核；
5、公示后，发放土地使用证。
根据《土地管理法实施条例》第四条第二款的规定，农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由土地使用者向土地所在地的县级土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级登记造册，核发集体土地使用权证书，确认建设用地使用权。
二、集体土地所有权确权的规定
农民集体所有的土地依法属于村农民集体所有的，由村集体经济组织或者村民委员会经营、管理；已经分别属于村内两个以上农村集体经济组织的农民集体所有的，由村内各该农村集体经济组织或者村民小组经营、管理；已经属于乡（镇）农民集体所有的，由乡（镇）农村集体经济组织经营、管理。
三、集体土地上所建房屋可以买卖吗
集体土地上所建的房屋可以进行买卖的，但买受方必须为具有该村户口的村民；并且在房屋买卖中其土地相关权利也应当一并进行转让。我国《土地管理法》规定，农民集体所有的土地依法属于村农民集体所有的，由村集体经济组织或者村民委员会经营、管理。
【本文关联的相关法律依据】
《土地管理法实施条例》
第三条国家依法对土地实行登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
《土地管理法》
第十二条土地的所有权和使用权的登记，依照有关不动产登记的法律、行规执行。依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
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