合同协议纠纷可找人民调解委员会、仲裁委员会或人民调解。合同纠纷诉讼时效为三年，除特殊情况外。起诉需撰写起诉状、准备证据材料，向有管辖权的人民提起诉讼，并在七日内立案通知当事人。应保障起诉权利，符合条件的必须受理，不符合的应作出裁定书。
法律分析
一、合同协议纠纷找哪个部门
合同协议纠纷找人民调解委员会、仲裁委员会、人民调解。
根据《民事诉讼法》第九十三条规定，人民审理民事案件，根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。
《仲裁法》第五十一条规定，仲裁庭在作出裁决前，可以先行调解。当事人自愿调解的，仲裁庭应当调解。调解不成的，应当及时作出裁决。
调解达成协议的，仲裁庭应当制作调解书或者根据协议的结果制作裁决书。调解书与裁决书具有同等法律效力。
二、合同纠纷诉讼时效
合同纠纷的诉讼有效期为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
《民法典》第一百八十
向人民请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。
《民法典》第五百九十四条
因国际货物买卖合同和技术进出口合同争议提起诉讼或者申请仲裁的时效期间为四年。
三、合同纠纷怎么起诉
1.撰写起诉状、准备证据材料；
2.到有管辖权的人民提起诉讼，提交起诉状和证据材料；
3.认为符合起诉条件的，在七日内立案并通知当事人。
根据《民事诉讼法》第一百二十条第一款的规定，起诉应当向人民递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
第一百二十三条规定，人民应当保障当事人依照法律规定享有的起诉权利。对符合本法第一百一十九条的起诉，必须受理。符合起诉条件的，应当在七日内立案，并通知当事人；不符合起诉条件的，应当在七日内作出裁定书，不予受理；原告对裁定不服的，可以提起上诉。
结语
合同纠纷的处理部门包括人民调解委员会、仲裁委员会和人民调解。根据相关法律规定，人民在事实清楚的基础上，根据当事人自愿的原则进行调解。仲裁庭在作出裁决前也可以先行调解，调解达成协议后将制作调解书或裁决书。合同纠纷的诉讼时效为三年，时效期间从权利人知道或应当知道权利受损以及义务人之日起计算。对于起诉合同纠纷，需要撰写起诉状、准备证据材料，并向有管辖权的人民递交起诉状和证据材料。根据法律规定，人民应保障当事人的起诉权利，对符合起诉条件的案件应在七日内立案并通知当事人。
法律依据
《中华人民共和国仲裁法》第五十一条
《中华人民共和国民事诉讼法》第九十三条
《中华人民共和国民法典》第一百八十
《中华人民共和国民法典》第五百九十四条
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十条
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十三条
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