故事中，工藤柯南知道“黑衣组织”是一名犯罪组织，对身份变化负有责任。然而不敢直接去找黑衣组织有以下几个原因：
1、安全考虑：黑衣组织是特别危险的组织，拥有强大的实力和资源。作为一名小学生大小的柯南是没有足够的力量和组织抗衡的。如果柯南冒然与黑衣组织接触，会置自己和其他人于危险之中。
2、打击犯罪：柯南决心利用自己变小的身体和聪明智慧，深入调查黑衣组织的活动，并且秘密收集证据。希望借此向提供情报和帮助警方打击犯罪并最终抓住组织成员。
3、寻找解药：柯南希望能够找到解药，并恢复成原来的高中生身份，以便更好的和黑衣组织斗争。正因如此需要时间和机会调查组织的活动、研究药物，并想尽方法获取解救之道。
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