1、光合细菌是一种营养丰富，营养价值高的细菌，菌体含有丰富的氨基酸，叶酸、b族维生素，尤其是维生素b12和生物素含量较高，还有生理活性物质辅酶Q。
2、光合细菌施入水体后，它可降解水体中的残存饲料，鱼类的粪便及其它有机物。同时，还能吸收利用水体中的氨、亚盐、硫化氢等有害物质。施用光合细菌，能有效避免固体有机物和有害物质的积累，起到净化水源的作用。
3、光合细菌利用阳光合成有机物，而硅藻需要获取营养物质生长。同时，硅藻还可以释放出有机物和微量元素，为光合细菌提供生长所需的营养物质和微量元素。
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