法律分析：承包土地流转协议是农村土地流转的重要形式，其中涉及的民事责任也是需要明确的。根据相关法律规定，承包土地流转协议中的民事责任应当根据以下几个方面来界定。
法律依据：
1.《合同法》 第四十四条 中提到：“当事人应当按照约定履行义务。未约定或者约定不明确的，按照合同的性质和交易习惯以及诚信原则确定。”
2.《土地管理法》 第二十六条 规定：“农村土地承包经营权、农村宅基地使用权可以依法转让、转包、互换、赠与、抵押。农村土地承包经营权的转让等，应当签订书面合同。”
3.《中华人民共和国侵权责任法》 第六条 规定：“因非法侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。”
综上所述，承包土地流转协议中的民事责任应当根据双方的约定和合同的性质来确定，如果没有约定或者约定不明确的，应当参照交易习惯和诚信原则，按照合同的性质来确定责任。如果在流转过程中发生了侵权行为，应当根据《中华人民共和国侵权责任法》的规定承担侵权责任。
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