医疗机构发生医疗事故，根据《医疗事故处理条例》第五章第四十六条至第五十二条规定、第五十五、五十六条规定以及《刑法》第三百三十五条规定，依法承担下列责任：
1、民事赔偿责任：赔偿患者或家属经济损失。各项赔偿项目在《医疗事故处理条例》中已有详细规定，可以对号入座。具体数额的确定，患方可以通过卫生行政部门调解确定，也可以向人民提起民事赔偿诉讼确定。各项赔偿项目确定后一次性支付，赔偿结束后不得再反悔。
2、行政责任：对于医疗机构，由卫生行政部门根据医疗事故等级和情节，给予警告;情节严重的，责令限期停业整顿直至由原发证部门吊销执业许可证。对于发生医疗事故的人员，卫生行政部门或以责令暂停6个月以上1年以下执业活动;情节严重的，吊销其执业证书。
3、刑事责任：对负有责任的医务人员依照《刑法》第三百三十五条关于医疗事故罪的规定，依法追究刑事责任。
一、医疗事故的责任划分
根据《医疗事故技术鉴定暂行办法》第三十六条规定，医疗事故中医疗过失行为责任程度分为：
1、完全责任：
指医疗事故损害后果完全由医疗过失行为造成。(赔偿全部损失的100%)
2、主要责任：
指医疗事故损害后果主要由医疗过失行为造成，其他因素起次要作用。(赔偿全部损失的60-90%)
3、次要责任：
指医疗事故损害后果主要由其他因素造成，医疗过失行为起次要作用。(赔偿全部损失的20-40%)
4、轻微责任：
指医疗事故损害后果绝大部分由其他因素造成，医疗过失行为起轻微作用。(赔偿全部损失不超过10%)
实践中还存在对等责任：即医、患双方各负担50%。
责任程度的不同，对于赔偿数额的影响较大，显不了过错程序与承担责任一致的原则，比原《医疗事故处理办法》确定的只要鉴定为事故不考虑责任程度一律承担100%赔偿的内容较为公正、合情合理。
医疗事故鉴定书中的“主要责任”或“次要责任”抑或“轻微责任”，是对事故原因力的认定，其本来意义是“主要原因”或“此要原因”，只不过医疗行政部门对相关责任人的行政处分看来是以原因力作为主要依据，需要如此表述而已。
当然，医学会的鉴定结论，不是具体行政行为，不能提起行政复议和行政诉讼，其结论只是专家证言性质，在人民来说仅能起到证据的作用，没有绝对的约束力，如果当事人对鉴定结论之责任认定有争议的，如果合议庭认为有必要，可以单独就责任程度问题(即原因力分析)再提交人民法医室或委托有关专家作出认定。
医疗纠纷住院医师承担多少责任需要看他在该医疗纠纷中是否存在过失以及过失的严重程度。一般情况下，如果对患者造成的损害并不是特别严重，那么，只要对患者进行民事方面的赔偿即可，但是如果医生所造成的损害比较严重，且医生存在重大的违规等行为，法律会追究其相应的刑事责任。
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