灵活就业人员社保缴费可以通过以下几种方式进行：
1、自主缴费。灵活就业人员可以根据自己的实际情况选择合适的缴费档次，一般可选档次为当地上一年度社会平均工资的60%至300%。缴费金额的计算方法是根据缴费档次和当地上一年度社会平均工资。在缴费前，需要了解缴费基数调整、缴费比例变化、补缴规定、停保规定等注意事项。
2、线上办理。通过微信ȡ或支付宝ȡ等第三方平台进行缴费。例如，在支付宝上搜索“社保缴费”并进入相应的缴费模块，填写个人信息和缴费金额等相关信息后完成缴费。
3、线下办理。初次办理缴费通常需要线下操作。养老ȡ办理结束后，需要去指定银行缴费，医疗则只能在每月的1日至15日之间办理，错过这个时间可以补缴。
灵活就业人员社保缴费基数按照上一年当地的平均工资计算，可以分为五档：
1、一档：社保平均工资60%
2、二档：社保平均工资70%
3、三档：社保平均工资80%
4、四档：社保平均工资90%
5、五档：社保平均工资100%
综上所述，灵活就业人员在办理社保缴费时，应先办理养老，再办理医疗。养老可以随时办理，而医疗只能在每月的1日至15日之间办理。此外，办理医疗时可以选择是否包含生育保险，这可以根据个人情况决定。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》
第二十三条
职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。
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