1、土地权利人应当向原土地登记机关报失；土地权利人在土地登记机关规定的媒体上声明其土地证书灭失；土地权利人应提交补办土地证书的申请书、媒体上的声明原件；营业执照副本、组织机构代码、法人代表身份证明及身份证复印件、授权委托书、受托人身份证复印件；原权源资料等；
2、填写土地登记申请书、土地登记审批表，实地勘测；经审核，属补发之列的，土地登记机关应做出补发公告，自公告之日起30日内无异议的，予以补发。领导审批、签字、盖章；
3、单位领导审批、签字、盖章；补发的土地证书应注明“补发“字样，填写土地登记卡、归户卡。
二、土地使用权发生变更怎么办理手续？
依法改变土地所有权、使用权的，因依法转让地上建筑物、构筑物等附着物导致土地使用权转移的，必须向土地所在地的县级以上土地行政主管部门提出土地变更登记申请，由原土地登记机关依法进行土地所有权、使用权变更登记。土地所有权、使用权的变更，自变更登记之日起生效。依法改变土地用途的，必须持批准文件，向土地所在地的县级以上土地行政主管部门提出土地变更登记申请，由原土地登记机关依法进行变更登记。
根据《中华人民共和国城市房地产管理法》房地产转让或者变更时，应当向县级以上地方房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级土地管理部门核实，由同级更换或者更改土地使用权证书。
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