成年的绿树蟒体长平均约有90至120厘米，最高纪录为213厘米。它们的上唇鳞片的位置，有一双具备耐热功能的凹槽。它身体的颜色是鲜明的绿色，沿着脊柱位置有一条蓝色条纹，周身零星分布白色或黄色的鳞片。也有部分产地的绿树蟒背部只有黄、白色鳞片组成的线条。
幼体绿树蟒主要有淡黄、鲜红和砖红几种颜色。淡黄的个体背部有黑色为主的条纹，夹杂白斑；鲜红和砖红的个体背部条纹为白色为主，夹杂黑斑。同一窝孵化的绿树蟒幼体，可能同时出现各种颜色。幼体绿树蟒一般在出生后几个月至几年间，变换为成体的绿色调为主体色。个别产地的绿树蟒，成体后仍然会保持淡黄色的体色。
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