从外观来判断，雄性佛罗里达红肚龟腹甲有凹陷。个头会相对比雌性佛罗里达红肚龟龟小一些，龟壳颜色也会比较偏深，躯干较长而比较薄，尾巴长而细，雌性佛罗里达红肚龟则是腹甲平坦，壳也会偏浅，身体短而厚。
雄性佛罗里达红肚龟有异味并且比较浓烈，雌性佛罗里达红肚龟的异味相对比较淡。从泄殖孔来判断，雄性佛罗里达红肚龟的泄殖孔比较靠近尾端，孔型比较长，雌性佛罗里达红肚龟的泄殖孔更加接近于腹甲，孔形会相对比较圆。
