法律分析：一、本科毕业证单位要放在档案里吗
不是，个人档案跟学位证、毕业证这些东西属于不同保密级别的东西。
一般档案归档案，证书归证书，但不排除单位另外准备一个袋子，把你的档案（档案有自己的袋子）和证书放一起。
从道理上说，证书都是自己拿着的。
而个人档案里，主要是你从初中以来的各种表格，包括成绩，评语，体检报告，各种毕业登记表，奖惩记录什么的。如果工作过，还有单位评价，包括评选先进的登记表什么。
二、档案是什么?
1、国家规定，档案是不能自带的，也不能拆开的，必须挂靠在有人事接收权的单位，例如：人才市场、事业单位、国企、公务员等机构，才能享受人事服务;
2、档案袋必须密封保存，密封处加盖接收单位公章，拆开就失效;
3、档案从小伴着我们一起长大，内容：履历材料;鉴定、考核、考察材料;学历和评聘专业技术职务材料(包括学历、学位、学绩、培训结业成绩表和评聘专业技术职务、考绩、审批材料);政治历史情况的审查材料(包括甄别、复查材料和依据材料、党籍，参加工作时间等问题的审查材料)等。
法律依据：《中华人民共和国档案法》 第七条 机关、团体、企业事业单位和其他组织的档案机构或者档案工作人员，负责保管本单位的档案，并对所属机构的档案工作实行监督和指导。
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