一、药物及化学物质
常见引发此病的药物有氯霉素，磺胺类药，四环素，抗癌药，苯，驱虫药，杀虫药，农药，无机砷，三硝基甲苯，保泰松等。苯是工业用化学物品中用途最广，也是最重要的骨髓抑制毒物。它引起再障似与剂量无关，可能是一种特异性反应，具有易挥发性，非常容易被人体所吸入。
二、电离辐射
各种电离辐射也是再生障碍性贫血引起的原因，如X线、放射性同位素等，它们除了损伤造血干细胞外还可损伤造血的微环境，影响干细胞的增殖和分化。不同种细胞对电离辐射敏感性不同，损伤的程度与接触核辐射剂量有关。
三、感染引起再障
再生障碍性贫血引起的原因中感染引起的病死率高。因为有关的病毒既能影响肝脏，又会对骨髓造成影响，有不少原发性再障病例中在起病前曾有病毒性呼吸道感染。此外，还有细菌感染，如分支杆菌感染等，可能会引起全血细胞减少及再障。
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