注册1000万的公司一年要交的税分为：
1、应纳营业税1000万*5%=50万；
2、应纳个人所得税，因其收入超过4000元，所以应扣除20%的费用，所以其应纳税所得额为1000万*（1-20%）=800万，因其收入超过50000元，属收入畸高的，应加征10%。
具体包含以下两种情况：
1、没有营业的话是不需要特别缴纳税费的，每个月国税零申报就可以。地税的话，附税零申报，个人所得税需要根据实际用工情况进行申报，房产、土地使用税根据核定情况申报，注册资本1000万的印花税是需要申报缴纳的；
2、没有进项，只往外开票的话，首先确认是否实际发生了业务，是实际发生了业务，在进项没有到位的情况下，是需要全额缴纳税款的，不是实际发生，不要往出开风险太大，属于虚开。
是以商品含应税劳务在流转过程中产生的增值额作为计税依据而征收的一种流转税。从计税原理上说，是对商品生产、流通、劳务服务中多个环节的新增价值或商品的附加值征收的一种流转税。实行价外税，也就是由消费者负担，有增值才征税没增值不征税。
是对销售货物或者提供加工、修理修配劳务以及进口货物的单位和个人就其实现的增值额征收的一个税种。已经成为中国最主要的税种之一，的收入占中国全部税收的百分之六十以上，是最大的税种。由国家税务局负责征收，税收收入中百分之五十为财政收入，百分之五十为地方收入。进口环节的由海关负责征收，税收收入全部为财政收入。
法律依据
《中华人民共和国暂行条例》
第九条 纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产，取得的扣税凭证不符合法律、行规或者税务主管部门有关规定的，其进项税额不得从销项税额中抵扣。
