申请破产后还有债务的应当由破产财产进行偿还，债务人的破产财产在优先清偿破产费用和共益债务之后应当根据法律规定的顺序进行清偿，首先是所欠的职工工资等。
一、公司破产是否会优先偿还抵押权人
破产清算后，破产财产不会优先偿还抵押权人。破产清算后，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，保险费用以及法律、行规规定应当支付给职工的补偿金；所欠税款；普通破产债权。
二、破产财产分配原则和顺序是什么呢
破产财产分配原则如下：
1.优先清偿破产费用和共益债务的原则。
2.按法定顺序清偿原则。
3.破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按比例分配原则。
4.破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按该企业职工的平均工资计算的原则。
5.一次分配和多次分配相结合的原则。
6.除债权人会议另有决议外，破产财产的分配应以货币分配方式进行的原则。
《企业破产法》第一百一十三条，破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：
（一）破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行规规定应当支付给职工的补偿金；
（二）破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；
（三）普通破产债权。破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
三、公司破产了,私人财产也卖了银行怎么办
企业破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，应当先清偿职工工资，再清偿其他债权。公司破产,公司所欠债务,由公司的余下资产进行偿还.如公司资产不够清偿债务,按资产与债务的比例进行偿还.如股东未据实给钱,则股东应承受补齐给钱的职责.
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国企业破产法》第一百一十三条
破产财产在优先清偿破产费用和共益债务后，依照下列顺序清偿：
（一）破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行规规定应当支付给职工的补偿金；
（二）破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；
（三）普通破产债权。
破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。
破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
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