根据2011年新修订的《印花税暂行条例》，货物运输合同，立合同人需要按照运输费用的0．5‰缴纳印花税。货物运输包括民用航空运输、铁路运输、海上运输、内河运输、公路运输和联运合同。货物运输合同是按运输费用金额来计算，即使没有合同，有运费也要缴纳印花税，而且按全额计算印花税，不扣除进项税部分。但是运费中记载的装卸费、保险费等可以在计算印花税时扣除，例如一张运费中注明运费500，装卸费100，保险费50，则按500计算印花税。应纳税额不足1角的，免纳印花税。应纳税额在1角以上的，其税额尾数不满5分的不计，满5分的按1角计算缴纳。
一、如何确定运输合同的管辖
根据我国《民事诉讼法》第二十的规定，因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民管辖。
根据我国《民事诉讼法》第三十条的规定，因铁路、公路、水上和航空事故请求损害赔偿提起的诉讼，由事故发生地或者车辆、船舶最先到达地、航空器最先降落地或者被告住所地人民管辖。
因此，判断运输合同的管辖时，首先应当判定所发生的纠纷时侵权纠纷还是合同纠纷，如果是合同纠纷，适用第二十的规定；如果是侵权纠纷，则适用第三十条的规定。
二、什么样的合同是运输合同
订立货物运输合同，应贯彻优先运输国家指令性计划产品，兼顾指导性计划产品和其他物资的原则。如大宗货物的铁路运输，有条件的可按年度、半年或季度签订货物运输合同；也可以签订更长期限的运输合同；其它整车货物运输，应按月签订运输合同，零星货物运输，以货物运单作为运输合同。国家有统一的运输合同文本的，应使用统一的合同文本签订。
按年度、半年度、季度或月份签订的货物运输合同，应写明下列主要条款：
1、托运人和收货人的名称或者姓名及住所；
2、发货站与到货站的详细名称；
3、货物的名称（运输标的名称）；
4、货物的性质（是否属易碎、易燃、易爆物品）；
5、货物的重量；
6、货物的数量（如车种、车数、件数）；
7、运输形式（零担、速递、联运）；
8、收货地点；
9、违约责任；
10、费用的承担；
11、包装要求；
12、合同纠纷解决方式；
13、双方约定的其他事项等。
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