农村集体土地被依法征收后，应由当地的市、县国土资源局支付土地补偿费。《中华人民共和国土地管理法》实施条例第25条明确规定：市、县土地行政主管部门根据经批准的征用土地方案，会同有关部门拟订征地补偿、安置方案，在被征用土地所在地的乡（镇）、村予以公告，听取被征用土地的农村集体经济组织和农民的意见。征地补偿、安置方案报市、县批准后，由市、县土地行政主管部门组织实施。及第26条：土地补偿费归农村集体经济所有的规定，土地补偿费的支付主体为市、县国土资源局，支付对象为农村集体经济组织。有的土地承包经营户要求当地或占地单位支付土地补偿费的要求是错误的，而且，应支付给农村集体经济组织。
一、征地补偿费支付方式：
征地补偿款应当是直接发给被征地农民和农民集体。《关于规范国有土地使用权出让收支管理的通知》，有条件的地方，土地补偿费、安置补偿费以及地上附着物和青苗补偿费等相关费用中应当支付给被征地农民的部分，可以根据征地补偿方案，由集体经济组织提供具体名单，通过发放记名银行卡或者存折的方式直接发放给农民。
二、征地补偿费计算方法
国家建设依法征用集体土地时付给被征地者补偿所丧失的土地权利的费用。其计算方法是：
①征用耕地的补偿费为该耕地被征用前三年平均年产值的6—10倍；征用其他土地的补偿费标准由省、自治区、直辖市参照征用耕地的补偿费标准，结合当地实际情况具体规定。属于有收益的非耕地的土地补偿费，可按该土地征用前三年平均年产值的3—6倍计算，征用无收益的耕地不予补偿。征用柴山、滩涂、水塘、苇塘、经济林地、草场、牧场等有收益的非耕地的土地补偿标准为该土地被征用前三年平均年产值的6—10倍。
②征用人工鱼塘、养殖场、宅基地、果园及其它多年生经济作物的土地，按邻近耕地补偿标准计算。
③被征用土地的青苗补偿费标准，由省、自治区、直辖市规定。
④被征用土地上的附着物，由省、自治区、直辖市自行制定。参照建筑造价折多少，补偿多少。
⑤征用城市郊区的菜地，用地单位应按国家有关规定缴纳新菜地开发建设基金。
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