专利纠纷案件由知识产权、最高人民确定的中级人民和基层人民管辖。涉及专利纠纷的案件大多数都是专业性强、技术含量高、过程复杂的案件，需要专利部门专业判定。当发生专利纠纷时，专利管理机关就可以很方便地组成具有相应专业知识人员的专案组、合议组对其进行查处。专利管理机关调处专利纠纷案件时，一般采用民事诉讼的简易程序，所以专利管理机关对专利纠纷案件的查处手段、过程等环节就变得更为简洁。这样，可使案件的办案人员在人力、物力、财力资源的投人就相对减少，使办案费用降低。
专利管理机关对上述纠纷所作出的处理决定，当事人不服的，可以向专利管理机关所在地的中级人民起诉，当该对专利案件无管辖权时，当事人可以向专利管理机关所属省、自治区、直辖市所在地的中级人民起诉。双方当事人在规定的期限内没有向人民起诉的，专利管理机关的处理决定即发生法律效力。专利管理机关对侵权行为作出的处理决定，当事人期满不起诉，又不履行的，专利管理机关可以请求人民强制执行。
一、专利权纠纷包括哪些类型？
1、使用发明创造的费用纠纷
专利申请公布或公告后专利权授予前使用发明创造的费用纠纷。
2、关于实施强制许可使用费的纠纷
强制许可就是非自愿许可，是指国家的专利主管机关不经专利权人的同意，经过行政程序允许符合条件的第三人利用该项发明专利或者实用新型专利，并向其颁发强制许可证，目的是专利权人垄断专利权。但是，被许可使用人应当向专利权支付使用费。有关当事人因此引起纠纷，可向人民起诉。
3、专利侵权纠纷
该类纠纷较多，主要包括未经专利权人许可，非法实施他人专利权的纠纷；假冒他人专利的纠纷；专利行政侵权纠纷，即专利机关作出了不符合专利法规定的专利实施强制许可决定和宣告专利权无效的决定，侵犯甚至剥夺了专利权人合法权利而引起的纠纷。
4、专利权归属纠纷
是指发明创造在被授予专利权之后，有关当事人之间就谁应当是真正的权利人所发生的确权纠纷。专利权属纠纷最常见的是职务发明还是非职务发明的争议，以及某项专利权是否属于共有而产生的争议。
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