集体土地使用证和房产证二者存在的区别是：
1、办理机构不同。房产证在房管局办理登记；集体土地使用证在国土资源管理局办理；
2、权限不同。集体土地使用证证只发给具备建房条件的农村村民；而房产证是发给拥有房子所有权权的单位或个人的，只要有合法的权属依据，任何人都可以申领房产证。
【本文关联的相关法律依据】
《民法典》第二百一十一条
当事人申请登记，应当根据不同登记事项提供权属证明和不动产界址、面积等必要材料。
第二百一十七条
不动产权属证书是权利人享有该不动产物权的证明。不动产权属证载的事项，应当与不动产登记簿一致；记载不一致的，除有证据证明不动产登记簿确有错误外，以不动产登记簿为准。
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