1、单证纠纷。
单证纠纷主要发生在承运人和托运人之间。此类纠纷包括：因单证瑕疵引起的纠纷；因承运人签发单证时的失误引发的纠纷；因托运人未与收货人达成协议，却要求签发特殊单证（倒签或预借提单）而在承运人与托运人之间产生的纠纷。
2、货物损失、灭失的纠纷。
该类纠纷一般发生在承运过程中。造成此类纠纷的原因很多，可能是由于托运人自身的过失造成的，如包装不良、标识不清引起，也可能是承运人的过错造成的，如积载不当、操作失误、运具选择不当等。另外，还有不可抗力造成的货物损失、灭失，应根据风险分配原则分担风险。
3、延迟交付纠纷。
这是指因承运人在合同约定期限以后进行交付而发生的纠纷。纠纷发生的原因主要有：因承运货物发生交通事故；因积载能力而必须将货物延迟发送；因过失造成中转滞留；因某种原因而绕行导致发生纠纷。
4、运杂费纠纷。
这是因为托运人或收货人的故意或过失，未能及时或全额交纳运费，以及因在履行合同中所发生的其他费用而发生的纠纷。
5、运输工具损害纠纷。
这是指因托运人的过失，造成对承运人的运输工具损害而引发的纠纷。
法律依据：
《民法典》规定了运输合同是承运人将旅客或者货物从起运地点运输到约定地点，旅客、托运人或者收货人支付票款或者运输费用的合同。
一、承运人的过失责任及过失免责情形有那些
我国法律在规定承运人的损害赔偿责任的同时，也明确了承运人的法定免责事由，以过失为承运人责任构成要件，并由承运人负举证责任。在实践中，承运人举证责任不能免除，承运人无法证明其无过错的，推定其有过错，在责任后果上与无过错责任并无区别。
在下列情况下，即使货物发生了毁损、灭失的事实，承运人也可以免除责任。
1、不可抗力
即无法预见、不能避免和不能克服的客观情况。如地震、海啸等自然灾害。不可抗力作为人力所不能抗拒的法定免责条件，也同样适用于货物运输合同中货物的毁损、灭失情形；
2、货物的自然属性或合理损耗
货物的自然性质是指货物的内在属性。由货物的成分、品质决定，并使货物呈现出不同的特性。如液体货物在运输过程中的自然挥发等。属于货物本身的自然性质或者因货物自然特性和运输特性不可避免的合理损耗所造成的货物的毁损、灭失，与承运人的运输行为没有关系，所以不应当由承运人承担责任；
3、托运人、收货人的过错
将危险物品按照普通物品包装等属于托运人、收货人的过错造成的货物的毁损、灭失，与承运人的运输行为无关，所以也不应当由承运人承担责任。
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