燕窝如果是轻微的发霉用牙刷沾点水分擦净或去掉后可以食用，这样就不会有霉味。但是中重度的发霉就不建议再食用了，不仅营养成分丢失，还可能对人体的健康造成影响。干燕窝的保质期一般是3年，想要延长干燕窝的保质期，保存的时候就一定要切记避光和防潮。避光是避免燕窝受紫外线影响而发黄严重，防潮是为了避免燕窝发霉。
