法律分析：公司电子印章申请流程如下：
1、依法批准设立或者登记的证件、文书；
2、有上级或者主管部门的，应当出具上级或者主管部门的介绍信；
3、提供经办人有效身份证件原件、复印件及联系方式；
4、需要制作包含外文或者少数民族文字电子印章的，应当提供经本单位或者机构确认的翻译文本。
一、电子印章需要的证件如下：
1、营业执照、法人身份证、公章、经办人身份证到印章门店申请办理电子印章；
2、需填写申请书，盖公章并申请人签名；
3、扫描证件原件、申请书等。
二、不适用电子印章的情形如下：
1、涉及婚姻、收养、继承等人身关系的；
2、涉及土地、房屋等不动产权益转让的；
3、涉及停止供水、供热、供气、供电等公用事业服务的；
4、法律、行规规定的不适用电子文书的其他情形。
总之，电子印章的申请使用电子印章的组织首先需要到电子印章中心申请电子印章，在履行完正常手续并确认无误、合法的情况下，为申请者制作电子印章，并将制作好的电子印章导入特定的存储介质，并提交给申请者。
法律依据：《中华人民共和国电子签名法》
第五条 符合下列条件的数据电文，视为满足法律、法规规定的原件形式要求：
（一）能够有效地表现所载内容并可供随时调取查用；
（二）能够可靠地保证自最终形成时起，内容保持完整、未被更改。但是，在数据电文上增加背书以及数据交换、储存和显示过程中发生的形式变化不影响数据电文的完整性。
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