办理涉民营企业案件要坚决防止将经济纠纷当作犯罪处理，坚决防止将民事责任变为刑事责任。
1、经审查认定案件不构成犯罪，包括涉案民营企业经营者没有犯罪事实，或者具有其他法律规定的免予追究刑事责任情形的，应当作出不起诉决定。
2、经审查认定案件构成犯罪，但犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，可以作出不起诉决定，防止“入罪即诉”“一诉了之”。
3、经审查认定案件事实不清、证据不足，经过二次补充侦查仍然证据不足，不符合起诉条件，或者经过一次退回补充侦查，仍然证据不足，不符合起诉条件且无再次退回补充侦查必要的，应当作出不起诉决定，坚决防止“带病起诉”。
3、经审查认定案件符合规定，涉案民营企业经营者自愿如实供述涉嫌犯罪的事实，有重大立功或者案件涉及国家重大利益的，经最高人民核准，人民可以作出不起诉决定。
民营企业法人被逮捕的情况下，可以行使企业法利吗？
1.企业法人是不会被逮捕的，只有其法定代表人有被逮捕的可能
2.如果法定代表人被逮捕的，他将依法不能行使代表职能，而不是行使企业法利。在法定代表人被逮捕或者被指控犯罪的前提下，由企业法人的其他主要负责人作为诉讼代表人。依据是刑诉法解释20
3.私企国企都一样，以单位算，不以所有制区分
综上所述，国家相关部门已经明确规定：对不符合逮捕条件，或者具有刑事诉讼法第十六条规定情形之一的民营企业经营者，应当依法不批准逮捕；对有自首、立功表现，认罪态度好，没有社会危险性的民营企业经营者，一般不批准逮捕；对符合监视居住条件，不羁押不致发生社会危险性的民营企业经营者，可以不批准逮捕。
【法律依据】：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条
【依法不追诉原则】有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：
（一）情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；
（二）犯罪已过追诉时效期限的；
（三）经特赦令免除刑罚的；
（四）依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；
（五）犯罪嫌疑人、被告人死亡的；
（六）其他法律规定免予追究刑事责任的。
