主要包括以下几种情况：

1、集体所有的土地依法被全部征用或者农村集体经济组织所属成员达成建制转为城镇居民的集体土地所有权、集体土地使用权注销登记。

2、国家组织移民，农民集体成建制迁移后不再使用的原农民集体土地所有权、集体土地使用权注销登记。

3、因自然灾害等原因造成土地权利灭失的土地使用权或者土地所有权注销登记。

4、县级以上依法收回国有土地使用权的国有土地注销登记。

5、国有土地使用权出让或者租赁期限届满后未申请续期或续期申请未获批准的国有土地使用权注销登记。

6、土地他项权利终止的土地他项权利注销登记

有下列情形之一的，登记部门可以决定撤销全部或部分已核准的登记事项：

1、当事人在申请登记时隐瞒真实情况或以伪造有关证件等欺骗手段获准登记的;

2、核准登记事项错误或不当的。

一、判决撤销土地使用权案能用反证法吗

不能。收回国有土地需要经过以下几个方面的程序：拟订收回方案、听证、报批、下达决定书、注销登记、补偿等。

(1)拟订收回方案：土地行政主管部门根据市或县级的批准调整用地的文件，拟迁移、解散、撤销、破产的企业(或其上级主管部门)的申请或者土地管理部门决定收回的处理意见，拟订收回国有土地使用权方案，并将拟收回国有土地使用权事宜通知原土地使用权人，并告之听证的权利。

(2)听证：土地使用权人要求听证的，应当在接到收回国有土地使用权通知后的一定期限内向市或者县级土地行政主管部门提出。土地行政主管部门接到听证申请后，应该按照《国土资源听证规定》中规定的期限内组织听证。

(3)报批：土地行政主管部门在组织听证后规定的一定期限内，将所拟订的收回国有土地使用权方案连同听证结果报市或者县级审批。

(4)下达收回决定书。根据市或县级批准的收回国有土地使用权方案，土地行政主管部门应当在批准之日起一定期限内，向原土地使用权人下达《收回国有土地使用权决定书》，同时告知原土地使用权人申请复议和提起诉讼权利。对收回国有土地使用权决定不服的，可以在接到提前收回国有土地使用权决定后若干期限内(按照《行政复议法》规定，一般是60天)，依法向上级行政机关或者人民申请行政复议或者起诉。

(5)注销登记。土地行政主管部门在下达《收回国有土地使用权决定书》后，由原登记发证机关办理注销土地登记，收回国有土地使用证，并发布收回国有土地使用权公告。对于出让的土地，还应当依法终止国有土地使用权出让合同。被收回土地已经设定抵押的，在收回土地使用权之前，由抵押人与抵押权人协商解除抵押合同，并向登记机关办理注销抵押登记手续。原土地使用权人或者抵押权人对收回国有土地使用权决定提出异议的，不影响收回国有土地使用权行政行为的执行。

(6)补偿：因使用期届满，无偿取得划拨土地使用权的土地使用者，因迁移、解散、撤销、破产或者其他原因而停止使用土地，需要收回土地使用权，或者因土地使用权人违法等自身原因收回土地使用权的，对原土地使用权人不予补偿。对因公共利益需要收回土地使用权的，由新的土地使用权人负责补偿。采用货币补偿的，其补偿标准由市或者县级在评估的基础上，依据实际使用年限和开发土地的实际情况确定。收回土地使用权涉及地上物处理的，按照《城市房屋拆迁管理条例》执行。