重复缴纳的社保费最终退到缴费人指定的账户中，申请退回方式如下：
1、持离职员工的离职证明、缴费票据到地税申请退费，并由地税部门重新确定缴费基数；
2、到企业参保的养老保险经办机构办理当月做实账户删除；
3、到市社会养老和工伤保险管理局企业处办理申请退费手续（退费材料中必须包括地税出具的认定缴费基数错误的证明、缴费票据、退费申请表）；
4、办理完上述的手续之后到地税退费，并向地税申报正确缴费。参保人员原则上，不应当重复参加城镇职工养老保险，或者是城乡居民养老保险。若参保人员在同一年度内重复参加，城镇职工养老保险和城乡居民养老保险的。优先保留城镇职工养老保险关系，按月清退城乡居民养老保险重复时段的缴费。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第二十九条
参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。
社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
