1、使用不同。小规模纳税人销售只能使用普通，不能使用专用，购买货物与一般纳税人相同，可以收普通也能收专用，二者收取专用后帐务处理不同。一般纳税人按价款部分入成本，税款部分入“应交税金--应交--进项税额”帐户；小规模纳税人则按全额进入成本。
2、应交税金的计算方法不同。一般纳税人按“抵扣制”计算税金，即按销项减进项后的余额交税。小规模纳税人按销售收入除于适用税率后的金额再乘税率计算应交税金，工业6%，商业4%。
3、税率不同。一般纳税人分为0税率、13%税率、17%税率。小规模纳税人，商业企业按4%；工业企业按6%（免税的除外）。
一、小规模纳税人的计算
中小规模纳税人应纳税额的计算公式为：
应纳税额＝销售额×征收率（适用于小规模纳税人的的征收率为3％。）
对小规模纳税人采用简易征收办法，对小规模纳税人适用的税率称为征收率。
考虑到小规模纳税人经营规模小，且会计核算不健全，难以按税率计税和使用专用抵扣进项税额，因此实行按销售额与征收率计算应纳税额的建议办法。自2009年1月1日起，小规模纳税人征收率由过去的6％和4％一律调整为3％，不再设置工业和商业两档征收率。征收率的调整，由决定。
按简易办法征收的纳税人，的征收率为2％、3％、4％或6％。
小规模纳税人（除其他个人外）销售自己使用过的固定资产，减按2％征收率征收。只能够开具普通，不得由税务机关代开专用。
二、机械费的税率是多少
机械设备公司一般纳税人适用税率是17%。如果对方是一般纳税人，给你开的机械专用税率是17%的。如果对方是小规模纳税人，对方去税务局代开的机械专用税率是3%的。单单租赁机械，出租方没有提供操作人员，属于动产经营租赁。这一种情况为：出租方只出租机械，没有提供施工操作人员，属于现代服务业里的动产经营租赁。动产经营租赁的税率为16%，简易征收计税下征收率为3%。具体怎么缴税和开具，这要分具体情况来分析。
①出租方为个人，没有办理营业执照。个人可以到税务局申请代开，开具的只能为普通，不能申请代开专用。征收率为3%，城建税、教育费附加和地方教育费附加合计为税款的12%。另外还要预交个人所得税1%，这个预计税率每个地区略有差异。②出租方办理了营业执照，为小规模纳税人。机械租赁开具，可以自行领取普通开具，需要开具专用只能向税务局申请代开。征收率为3%，附加税费合计也为12%。季度销售额不超过9万元，可以免交和附加税费。
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